El clima en la zona Quechua es Templado y en la zona Puna Frío, las estaciones se dividen en dos periodos seco y húmedo.

La temperatura fría moderada se acentúa en los meses de invierno a partir del 21 de junio al 22 de setiembre, estación en la que se producen intensas heladas y un verano que se inicia a partir del 21 de Diciembre al 21 de Marzo, aproximadamente estación que se presenta con una intensidad de lluvias.

Las temperaturas medias anuales en el Cusco fluctúan entre los 10.3 y 11.3 grados celsius. Los meses en los que se produce la más baja temperatura son Junio y Julio donde las temperaturas fluctúan entre 5 y 7 grados bajo cero, sin embargo los meses en que se registran las heladas van desde Mayo hasta Agosto.